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Nature:稻瘟菌分泌 lncRNA 跨界结合水稻 miRNA,揭示非蛋白效应子新机制

2026-06-18 8520 10M 0

稻瘟病是水稻最严重的真菌病害之一,导致全球年减产 10%~30%。传统观点认为,病原菌主要分泌蛋白质效应子或小 RNA 来抑制宿主免疫。然而,大量非编码 RNA 是否也参与跨界调控,长期缺乏直接证据支持。


近期,四川农业大学陈学伟/贺闽团队在国际顶尖学术期刊 Nature(IF 48.5)上发表一项重磅研究成果「A pathogen lncRNA secreted into rice sequesters a host miRNA for virulence」 。该研究报道了一种真菌长链非编码 RNA(lncRNA)作为非蛋白类效应分子,通过胞外囊泡(EVs)跨界进入水稻细胞,以 RNA-RNA 互补配对方式结合宿主 miRNA,从而抑制水稻免疫、促进侵染的分子机制。相关调控 DNA 序列在微生物和植物中具有保守性,为作物广谱抗病育种和病害绿色防控提供了新思路[1]


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核心发现:lnc117761 是稻瘟菌致病的关键因子


研究团队通过 RNA-seq 分析了稻瘟菌不同发育阶段的转录组,鉴定出一个在侵染阶段(附着胞和侵染菌丝)高表达的 lncRNA(lnc117761)。构建敲除突变体 Δlnc117761 后,稻瘟菌在水稻上形成的病斑长度和真菌生物量均显著下降,不同突变型回补可恢复致病性;在另外 3 个稻瘟菌菌株中敲除该 lncRNA,同样观察到致病力减弱,表明其功能具有保守性。进一步实验表明,lnc117761 编码蛋白的能力被破坏后,致病力仍可恢复,证实其功能依赖于 RNA 本身而非蛋白编码。此外,水稻中异位表达 lnc117761,会增强水稻对稻瘟病的感病性。Δlnc117761 菌株在营养生长、胁迫响应、附着胞形成无缺陷,但侵染菌丝发育受阻。上述结果共同表明,lnc117761 是一个非编码 RNA 类效应分子,能够负向调控水稻免疫。


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Fig. 1 Fungal lnc117761 is required for M. oryzae pathogenicity and capable of pairing with rice miR5827.


分子机制:lnc117761 作为「miRNA 海绵」释放免疫负调控因子


研究团队进一步发现,lnc117761 可通过一段 21 nt 的保守序列与水稻 miR5827 直接结合。miR5827 的靶基因为 PKR1,该基因是水稻免疫的负调控因子。正常情况下,miR5827 通过抑制 PKR1 维持水稻基础抗病性;而稻瘟菌分泌的 lnc117761 进入水稻细胞后,与 miR5827 结合,解除 miR5827 对 PKR1 的抑制作用,从而抑制宿主免疫,促进侵染。


跨界运输的关键证据:胞外囊泡介导的 lnc117761 递送


验证「lnc117761 确实从真菌进入水稻细胞」是支撑上述模型的核心环节。研究团队从稻瘟菌培养液中分离出 EVs,通过透射电镜、纳米颗粒追踪分析和 PKH26 脂溶性染料(UR52302)染色确证 EVs 的完整性。RT-qPCR 显示 lnc117761 在 EVs 中高度富集。团队进一步构建了 lnc117761-4×Pepper 融合 RNA 表达菌株,在水稻叶鞘中观察到红色荧光信号出现在不含菌丝的水稻细胞区域,直接证明了 lnc117761 经 EVs 跨界递送进入水稻细胞。


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保守性与应用潜力


序列分析表明,lnc117761 与 miR5827 的 21 nt 互补结合位点在微生物和植物中具有一定保守性。研究团队还在水稻纹枯病菌和禾谷镰刀菌中验证了类似调控机制,并初步证实外源施用合成 miRNA 模拟物处理可增强作物抗病性。这些结果提示该 RNA-RNA 互作机制可能代表一种广泛存在的跨界生物互作模式,并为广谱作物病害防控提供新靶点。



整体研究成果及意义总结



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内容策划:沈佳钰

内容审核:吴军

题图来源:图虫创意


参考文献:

[1] A pathogen lncRNA secreted into rice sequesters a host miRNA for virulence.Nature.2026 May 20:https://doi.org/10.1038/s41586-026-10572-x.




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