卵巢透明细胞癌(Ovarian Clear Cell Carcinoma,OCCC)是一类具有独特生物学特征的卵巢上皮性肿瘤。与高级别浆液性卵巢癌相比,OCCC对铂类化疗反应较差,尤其在疾病复发后缺乏有效的治疗手段。因此,寻找驱动OCCC发生发展的关键分子及可干预靶点已成为当前研究的重点。近年来,随着转录组学研究的不断深入,人们逐渐认识到肿瘤发生发展不仅受到基因突变和转录调控的影响,翻译水平的调控同样在肿瘤进程中发挥关键作用。 2026年6月5日,北京协和医院孙健/王姝/郭丹研究团队在国际知名期刊Oncogene上发表了题为“The translation landscape of ovarian clear cell carcinoma indicates that RBM4 plays a pro-oncogenic role in tumor progression”的研究成果。 研究团队通过核糖体测序(Ribo-seq)技术构建了OCCC翻译组图谱,并整合22例临床样本的转录组与翻译组数据,在密码子分辨率水平系统解析了OCCC中的翻译调控特征。研究发现,OCCC中存在广泛的翻译重编程现象,并鉴定出大量此前未被注释的非经典开放阅读框(ORFs),提示其可能蕴含丰富的潜在微肽编码资源。进一步研究表明,部分关键肿瘤相关因子可通过翻译层面的异常调控被激活,其中RNA结合蛋白RBM4表现出明显的翻译增强,并被证实能够促进OCCC细胞增殖和肿瘤进展。该研究揭示了翻译调控在OCCC发生发展中的重要作用,为理解其分子机制及探索新的治疗靶点提供了新的视角。
为系统解析卵巢透明细胞癌(OCCC)的翻译调控特征,研究团队对14例OCCC肿瘤组织和8例正常子宫内膜组织进行了转录组测序(RNA-seq)和核糖体测序(Ribo-seq)联合分析。结果显示,核糖体保护片段(RPFs)具有典型的三核苷酸周期性特征,并主要富集于编码序列(CDS)区域,表明获得了高质量的活跃翻译数据。 进一步利用RiboCode鉴定发现,除经典蛋白编码ORF外,OCCC中还存在大量非经典ORF,包括uORF、dORF、重叠ORF以及来源于非编码RNA的新型ORF,提示OCCC翻译组中广泛存在非经典翻译事件。整合转录组与翻译组数据发现,mRNA表达水平与翻译活性相关性较低,说明翻译调控是影响OCCC基因表达的重要调控层级。 图1 OCCC活跃翻译图谱·研究结果·
1、OCCC活跃翻译图谱

基于Ribo-seq数据,研究团队进一步比较了OCCC与正常组织之间的翻译效率(Translation Efficiency, TE)差异,共鉴定出293个差异翻译效率基因(DTEGs)。功能分析显示,异常翻译调控主要涉及mTOR信号通路、炎症反应、细胞生长以及糖酵解等肿瘤相关过程,提示OCCC可能通过选择性增强特定通路蛋白合成,形成独特的翻译调控模式。 图2 OCCC中广泛存在的翻译失调现象2、OCCC中广泛存在的翻译失调现象

为了系统解析转录调控与翻译调控对OCCC基因表达的相对贡献,研究团队整合差异翻译效率基因(DTEGs)和差异转录基因(DTGs)数据,将基因表达变化划分为“Exclusive(仅翻译调控)”“Forwarded(仅转录调控)”“Buffered(转录与翻译相互抵消)”和“Intensified(转录与翻译协同增强)”四种模式。分析发现,Exclusive基因表现为mRNA水平无明显变化,但翻译效率显著改变,共发现205个相关基因,包括RBM4等潜在肿瘤相关分子。“Forwarded”基因群主要富集于T细胞受体信号通路、JAK-STAT信号通路及凋亡等经典转录调控过程;而仅有少数基因属于“Intensified”模式,表现出转录与翻译双重协同激活。 图3 OCCC中转录与翻译的差异性调控3、OCCC中转录水平和翻译水平上的基因表达差异调控

在205个Exclusive基因中,研究团队进一步关注RBM4。结果发现,RBM4在OCCC中呈现“mRNA降低而蛋白水平升高”的表达解耦现象。多聚核糖体分析进一步证实RBM4翻译效率显著增强,提示RBM4可能通过翻译水平激活参与OCCC进展。 图4 OCCC中翻译事件的验证4、OCCC中翻译事件的验证

为进一步验证RBM4对肿瘤增殖及代谢表型的调控作用,研究团队利用慢病毒介导RBM4稳定敲低(Lenti-RBM4-shRNA),在OCCC细胞及类器官模型中建立RBM4功能缺失体系。实验结果显示,RBM4敲低显著抑制OCCC细胞增殖能力,同时降低类器官形成和生长能力,表明RBM4对OCCC肿瘤细胞维持具有重要作用。 此外,RBM4缺失可降低细胞糖原积累水平,提示RBM4可能参与调控OCCC特有的代谢重编程过程。这些结果证明,RBM4并非传统认知中的抑癌因子,而是在OCCC中通过翻译水平异常激活发挥促肿瘤作用,为探索OCCC新的治疗靶点提供了潜在方向。 图5 RBM4在OCCC中的促肿瘤作用5、RBM4在OCCC中的促肿瘤功能

综上,该研究建立了OCCC翻译组图谱,揭示了肿瘤发生过程中被传统转录组分析遗漏的翻译调控异常。研究发现,OCCC通过选择性增强特定基因和代谢通路的翻译效率,形成独特的翻译重编程模式,并鉴定出RBM4这一受翻译层面调控的关键促癌因子。该发现不仅深化了对OCCC复杂分子机制的理解,也为从翻译调控角度寻找新的治疗策略提供了新的思路。 ·结论·
和元生物有幸为研究者提供实验中用的pSLenti-U6-NA-shRNA-CMV-EGFP-F2A-Puro-WPRE和pSLenti-U6-RBM4-shRNA-CMV-EGFP-F2A-Puro-WPRE慢病毒,以实际行动助力基础研究!和元助力
和元生物成立于2013年,作为深耕细胞和基因治疗核心领域的高新技术企业,专注于为细胞和基因治疗的基础研究提供基因治疗载体研制、基因功能研究、药物靶点及药效研究等CRO服务,可提供①组学服务:常规转录组、单细胞转录组、基因组、代谢组及蛋白组等。②载体构建和病毒包装:质粒、siRNA、腺相关病毒(AAV)、腺病毒(ADV)、慢病毒(LVV)、逆转录病毒(RV)、单纯疱疹病毒(HSV)等病毒载体生产服务,提供R&D、实验室级别、GMP级别满足研发、小动物、大动物NHP到临床的不同研究阶段的使用需求。③细胞实验服务:过表达、干扰稳定株构建,单克隆细胞株构建服务及细胞功能学、药效学实验服务。④动物实验及机制研究:神经、代谢、肿瘤动物模型、药效药代、病理切片及蛋白、核酸检测服务。⑤特色项目服务:CRISPR文库筛选服务,外泌体整体研究服务,AAV衣壳筛选服务、听力研究整体项目服务,满足客户定制化或一站式项目服务,助力基础科学研究,促进基础研究到临床转化应用,推动细胞和基因治疗行业发展。联系我们

和元生物

