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百蓁团队突破微量测序难题:100%覆盖率与准确率

   2026-06-23 12000
导读

从“能测”到“微量精准测”单克隆抗体从头测序(De Novo Sequencing):是在不依赖基因序列数据库的前提下,直接从蛋白质水平解析抗体一级结构的核心技术。对于抗体研发和序列解析而言,珍贵/稀缺的微量样本的单抗测序一直是行业痛点。传统单抗从头测序流程对起始样品量要求很高,动辄需要几百甚至上千微克样品,常常因样

从“能测”到“微量精准测”

单克隆抗体从头测序(De Novo Sequencing):是在不依赖基因序列数据库的前提下,直接从蛋白质水平解析抗体一级结构的核心技术。

对于抗体研发和序列解析而言,珍贵/稀缺的微量样本的单抗测序一直是行业痛点。传统单抗从头测序流程对起始样品量要求很高,动辄需要几百甚至上千微克样品,常常因样品量不足无法完成测序,严重阻碍研发进度。

针对这一行业难题,百蓁生物团队对单克隆抗体从头测序全技术流程进行了系统性优化,实现技术重磅突破!如今仅需10 μg 以上起始样品量,即可完成单克隆抗体从头测序,实现抗体序列100%覆盖率和100%准确率,用硬核技术打破微量样品测序壁垒!

一、样品量为何是单抗测序最大阻碍?

基于质谱的单抗从头测序,需要借助多种蛋白酶(如 Trypsin、GluC 等)分别酶解获取互补肽段,再通过算法拼接得到完整轻重链序列。 传统方案中,每一种蛋白酶独立酶解都需要足量蛋白,整体样品消耗量居高不下,这对于珍贵或稀缺样品的单抗从头测序极不友好,因此,降低样品用量、坚守测序品质,成为单抗测序技术升级的核心方向。

 

二、四大维度全面优化,打造微量测序专属方案

百蓁生物团队围绕从头测序全技术流程深度打磨,多维度协同优化,兼顾低上样量高测序质量

1. 蛋白酶酶解方案精简与组合优化

筛选覆盖度最优的蛋白酶组合,在保证肽段互补性的同时减少酶解体系数量。每种蛋白酶的起始蛋白量优化至3 μg左右,多酶联合总投入量低至 10 μg。

2. 变性还原烷基化条件优化

针对低样品量体系,对变性剂浓度、还原剂用量和烷基化试剂用量进行精细调整,确保二硫键充分还原,避免非特异性修饰影响肽段识别率。

3. 酶解体系微量化与样品富集

开发了适合微量体系的酶解方案,优化酶与底物比例(E:S)、反应温度和时间,最大限度提高酶解效率;结合 C18 固相萃取(SPE)富集策略,有效提升低浓度样品的肽段上机量与信噪比。

4. LC-MS/MS 进样与数据采集参数优化

针对低上样量样品,进一步优化色谱梯度、进样量及质谱数据采集策略,提升质谱信号强度和谱图质量,为后续 De Novo 算法提供高质量的输入数据。

三、权威验证:阿达木单抗标准品实测,品质拉满

本次优化方案利用阿达木单抗(Adalimumab)作为质控,进行全流程验证。作为全球经典全人源 IgG1 单抗,其公开序列是方法学验证的黄金标准。

实验设计概要

  • 样品来源:市售阿达木单抗参考品(IgG1,κ 轻链,重链约 50 kDa,轻链约 23 kDa)

  • 前处理方案:采用优化后的多酶正交酶解流程,总投入量 10 μg(约 3 μg/每种蛋白酶)

  • 仪器平台:Orbitrap Eclipse 超高分辨率质谱仪,多碎裂模式(HCD/EThcD)

  • 数据分析:PEAKS® AB 全自动 De Novo 测序软件,结合人工核验

实验结果对比

结果显示:在样品量大幅缩减的前提下(10 μg 起始样品量),轻链与重链序列覆盖率均达到 100%,与公开参考序列比对准确率 100%,CDR 1-3 区域全部正确解析,I/L 区分置信度高。优化后的从头测序技术方案在显著降低样品消耗的同时,完整保留了测序质量。

 

四、六大核心服务优势,赋能抗体全研发周期

1. 样品用量行业领/先

总样品量低至 10 μg,单酶解仅需 约3 μg,完美适配各类微量稀缺样品。

2. 测序质量双重保障

100%序列覆盖率、100%序列准确率,结果真实可信。 

3. 全流程智能解析

PEAKS® AB 软件驱动,搭配资深技术团队人工复核,杜绝误差。

4. 顶/级硬件平台支撑

搭载 Orbitrap Eclipse高端质谱仪,HCD / EThcD 多碎裂模式采集,数据稳定性强。

5. 一站式闭环服务

从前处理、质谱检测、序列分析到正式报告交付,全程专人对接,省心高效。 

6. 周期短

最快3天交付正式报告。   

 

五、适用场景

◆ 杂交瘤来源单克隆抗体,上清或腹水制备,蛋白量有限

◆ 从临床血清 / 血浆中亲和纯化的特异性抗体

◆ 早期抗体发现阶段的候选克隆,尚未规模化制备

◆ 存档参考品或历史样品,无法补充来源

◆ 抗体-药物偶联物(ADC)或经化学修饰抗体的序列确认


相关公司:百蓁生物技术(武汉)有限公司
联系电话:027-59306009
E-mail:info@baizhenbio.cn

来源:生物器材网

 
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